教育部、财政部、国家发改委联合发布了《关于高等学校加快“双一流”建设的指导意见》，对当前高校落实“双一流”建设总体方案和实施办法提出具体指导，进一步明确建设高校的责任主体、建设主体、受益主体地位，引导高校深化认识，转变理念，走内涵式发展道路，确保实现建设方案的目标任务。

《指导意见》要求坚持中国特色社会主义办学方向，坚持和加强党的全面领导。构建课程、科研、实践、资助等一体化育人体系，坚持突出特色优势，突出质量水平，突出价值导向，突出服务效能等，把思想政治工作贯穿教育教学全过程、贯通人才培养全体系。在培养拔尖创新人才方面，强化本科教育基础地位，把一流本科教育建设作为“双一流”建设的基础任务，加快实施“六卓越一拔尖”人才培养计划2.0，建成一批一流本科专业；深化研究生教育综合改革，深化和扩大专业学位教育改革，大力培养高精尖急缺人才。

《指导意见》指出，需求是推动建设的源动力。建设高校要主动对接国家和区域重大战略，完善以社会需求和学术贡献为导向的学科专业动态调整机制。建设高素质教师队伍，要将师德师风作为第一标准，坚持引育并举、以育为主，坚决杜绝片面抢挖“帽子”人才等短期行为。深入推进高校教师职称、考核评价制度改革，突出教学一线需求。要全面提升科研水平，实施高等学校基础研究珠峰计划，建设一批前沿科学中心。加强协同创新，发挥高校、科研院所、企业等主体在人才、资本、市场、管理等方面的优势；推进中国特色哲学社会科学发展，打造高水平的新型高端智库。

《指导意见》要求，要明确学科建设内涵，坚持人才培养、学术团队、科研创新“三位一体”。突出优势与特色，分层分类推进学科建设，着眼于提高关键领域原始创新、自主创新能力和建设性社会影响。在学科育人方面，要以学科建设为载体，以人才培养为中心，强化科研育人，推进实践育人，加强创新创业教育。同时要打造高水平学科团队和梯队，完善开放灵活的引育机制，构建以学科带头人为领军、以杰出人才为骨干、以优秀青年人才为支撑，衔接有序、结构合理的人才团队和梯队。

《指导意见》要求将“双一流”建设纳入区域重大战略，更好服务地方经济社会发展；同时地方政府也要通过多种方式，对建设高校在资金、政策、资源等方面给予支持。

在评价督导方面《指导意见》也提出了具体措施。在评价方面，适度扩大高校自主设置学科权限，完善多元化研究生招生选拔机制，适度提高优秀应届本科毕业生直接攻读博士学位的比例。坚持多元综合性评价，以人才培养、创新能力、服务贡献和影响力为核心要素，把一流本科教育作为重要内容，探索中国特色现代高等教育评估制度。在督导检查方面，要充分发挥“双一流”建设专家委员会咨询作用，支持学科评议组、教育教学指导委员会等各类专家组织开展建设评价、诊断、督导，促进学科发展和学校建设，推进督导制度化常态化长效化。